પાયથોન બાહ્ય પ્રોગ્રામ્સ એક્ઝિક્યુટ કરવાની ઘણી રીતો પૂરી પાડે છે અને સીધી સ્ક્રિપ્ટમાંથી સિસ્ટમ કમાન્ડને કૉલ કરે છે. મુખ્ય પદ્ધતિઓમાં આદેશો ચલાવવા અને તેમના આઉટપુટને કેપ્ચર કરવા માટે સબપ્રોસેસ મોડ્યુલનો ઉપયોગ અને સરળ આદેશ એક્ઝેક્યુશન માટે os.system ફંક્શનનો સમાવેશ થાય છે. વધુમાં, shlex મોડ્યુલ શેલ આદેશોને યોગ્ય રીતે પાર્સ કરવામાં મદદ કરી શકે છે.