Budući da Instagramov preglednik unutar aplikacije obrađuje URL-ove na ograničen način, dubinske veze tamo često imaju problema s funkcioniranjem. To uzrokuje probleme za aplikacije koje koriste prilagođene sheme ili Univerzalne veze u okruženjima kao što je Flutter. Ovo se ograničenje može riješiti kako bi se osigurala neometana navigacija aplikacijom ispravnim konfiguriranjem datoteke apple-app-site-association, testiranjem ponašanja korisničkog agenta i istraživanjem alata kao što je urlgenius.