RXNFP 모듈 설치 오류 수정 가이드

RXNFP 모듈 설치 오류 수정 가이드
RXNFP 모듈 설치 오류 수정 가이드
Lucas Simon
2024년 5월 23일 목요일 오후 10:00:26

RXNFP 설치 문제 해결

Python에 RXNFP 모듈을 설치하는 것은 어려울 수 있으며, 특히 프로세스 중에 지속적인 오류가 발생할 경우 더욱 그렇습니다. 공식 지침을 따랐음에도 불구하고 일부 사용자는 특히 설치를 위해 pip 또는 git clone을 사용할 때 계속해서 어려움을 겪습니다.

이 문서에서는 RXNFP 모듈 설치 중에 발생하는 일반적인 오류 문제 해결에 대한 포괄적인 가이드를 제공하여 이러한 문제를 해결하는 것을 목표로 합니다. 환경 설정, 종속성 관리 및 보고된 오류에 대한 구체적인 해결 방법을 다룹니다.

명령 설명
conda create -n rxnfp python=3.6 -y Python 버전 3.6을 사용하여 'rxnfp'라는 새 Conda 환경을 만듭니다.
conda install -c rdkit rdkit=2020.03.3 -y 지정된 채널에서 RDKit 패키지를 설치합니다.
conda install -c tmap tmap -y TMAP 채널에서 TMAP 패키지를 설치합니다.
curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh Rustup을 사용하여 Rust 프로그래밍 언어를 설치합니다.
source $HOME/.cargo/env Rust 환경 변수를 현재 쉘 세션에 로드합니다.
rustc --version 설치된 Rust 컴파일러 버전을 확인합니다.
pip install -r requirements.txt 요구사항.txt 파일에 나열된 모든 Python 종속성을 설치합니다.
python setup.py install 설정 스크립트를 사용하여 Python 패키지를 설치합니다.
RXNModel.from_pretrained("rxnfp_model") 사전 훈련된 RXNModel을 로드합니다.

RXNFP 설치 문제 해결

제공된 스크립트는 Python에 RXNFP 모듈을 설치할 때 발생하는 일반적인 문제를 해결하도록 설계되었습니다. 첫 번째 스크립트는 Conda 환경을 설정합니다. conda create -n rxnfp python=3.6 -y, 다음을 사용하여 필요한 패키지를 설치합니다. conda install -c rdkit rdkit=2020.03.3 -y 그리고 conda install -c tmap tmap -y, 다음을 사용하여 RXNFP를 설치하기 전에 pip를 업그레이드합니다. 삼. 이를 통해 모든 종속성이 전용 환경 내에서 올바르게 처리되어 충돌 및 호환성 문제가 최소화됩니다. 또한 환경 관리를 위해 Conda를 사용하면 시스템의 다른 Python 프로젝트에서 RXNFP 모듈을 격리하는 데 도움이 됩니다.

두 번째 스크립트는 토크나이저와 같은 특정 패키지를 빌드하는 데 필요한 Rust 컴파일러 설치에 중점을 둡니다. Rust를 다운로드하고 설치하는 것으로 시작됩니다. curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh 그런 다음 Rust 환경 변수를 로드합니다. source $HOME/.cargo/env. 이 단계는 Rust 컴파일러가 시스템 PATH에서 올바르게 설정되고 액세스 가능하도록 보장합니다. 마지막으로 스크립트는 다음을 사용하여 설치를 확인합니다. rustc --version 다음을 사용하여 문제가 있는 패키지를 다시 설치하려고 시도합니다. pip install tokenizers 그리고 삼. 이 시퀀스는 누락되거나 오래된 Rust 컴파일러 문제를 해결하여 RXNFP를 성공적으로 설치할 수 있도록 합니다.

Conda 환경 설정 및 RXNFP 설치

환경 설정을 위한 셸 명령

conda create -n rxnfp python=3.6 -y
conda activate rxnfp
conda install -c rdkit rdkit=2020.03.3 -y
conda install -c tmap tmap -y
pip install --upgrade pip
pip install rxnfp

Rustup을 사용하여 Rust 컴파일러 설치

Rust 설치를 위한 쉘 명령

curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh
source $HOME/.cargo/env
rustc --version
echo "Rust installed successfully"
pip install tokenizers
pip install rxnfp

GitHub 리포지토리에서 RXNFP 설치

GitHub에서 복제 및 설치를 위한 셸 명령

git clone https://github.com/rxn4chemistry/rxnfp.git
cd rxnfp
pip install -r requirements.txt
pip install .
python setup.py install
echo "RXNFP installed successfully"

설치 확인 및 문제 해결

설치를 확인하는 Python 스크립트

삼

RXNFP 모듈 설치 문제 해결

RXNFP 모듈을 설치할 때 발생하는 또 다른 일반적인 문제는 필요한 모든 시스템 수준 종속성이 존재하는지 확인하는 것입니다. RXNFP 모듈은 컴파일해야 하는 여러 외부 라이브러리에 의존하며, 이를 위해서는 호환 가능한 C++ 컴파일러가 설치되어 있어야 합니다. 또한 RXNFP가 의존하는 특정 Python 패키지를 소스에서 빌드해야 할 수 있으므로 시스템에 기능적 빌드 환경이 있어야 합니다.

이러한 요구 사항을 해결하려면 macOS 시스템에 필수 개발 유틸리티를 제공하는 Xcode 명령줄 도구가 설치되어 있는지 확인하는 것이 도움이 되는 경우가 많습니다. 다음 명령을 사용하여 이러한 도구를 설치할 수 있습니다. xcode-select --install. 또한 가상 환경이나 Conda와 같은 도구를 사용하여 이러한 종속성을 관리하고 격리하면 잠재적인 충돌을 크게 줄여 설치 프로세스를 간소화하고 종속성 불일치와 관련된 문제를 방지하는 데 도움이 됩니다.

자주 묻는 질문 및 솔루션

  1. 새로운 Conda 환경을 만들려면 어떻게 해야 합니까?
  2. 명령을 사용하십시오 conda create -n myenv python=3.6 -y Python 버전 3.6으로 'myenv'라는 새 환경을 만듭니다.
  3. pip가 패키지 설치에 실패하면 어떻게 해야 합니까?
  4. 먼저 다음을 사용하여 pip를 업그레이드해 보십시오. pip install --upgrade pip. 문제가 지속되면 특정 종속성 오류를 확인하거나 다른 설치 방법을 사용해 보세요.
  5. macOS에 Rust를 어떻게 설치하나요?
  6. 명령을 사용하십시오 curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh Rust 툴체인 설치 프로그램인 Rustup을 통해 Rust를 설치합니다.
  7. RXNFP를 설치하는 데 Xcode 명령줄 도구가 필요한 이유는 무엇입니까?
  8. Xcode 명령줄 도구는 소스에서 특정 Python 패키지를 컴파일하는 데 필요한 컴파일러와 빌드 도구를 제공합니다.
  9. Rust가 올바르게 설정되었는지 확인하는 명령은 무엇입니까?
  10. 설치 후 실행 rustc --version Rust 컴파일러가 설치되어 있고 액세스할 수 있는지 확인합니다.
  11. Conda를 사용하여 RXNFP에 대한 종속성을 어떻게 처리합니까?
  12. 새로운 Conda 환경을 생성하고 다음을 사용하여 종속성을 설치합니다. conda install -c rdkit rdkit=2020.03.3 -y 그리고 conda install -c tmap tmap -y.
  13. 명령은 무엇입니까? pip install -r requirements.txt 하다?
  14. 요구사항.txt 파일에 나열된 모든 Python 패키지를 설치하여 모든 종속성이 충족되는지 확인합니다.
  15. GitHub에서 RXNFP 저장소를 복제하려면 어떻게 해야 합니까?
  16. 사용 git clone https://github.com/rxn4chemistry/rxnfp.git 저장소를 로컬 시스템에 복제합니다.
  17. 휠 제작 과정에서 오류가 발생하면 어떻게 해야 합니까?
  18. 필요한 모든 컴파일러가 설치되어 있는지 확인하고 pip를 업데이트해 보세요. 운영 체제와 관련된 추가 빌드 도구를 설치해야 할 수도 있습니다.

RXNFP 설치 프로세스 마무리

RXNFP 모듈을 성공적으로 설치하려면 올바른 환경을 설정하고 모든 종속성과 빌드 도구가 올바르게 구성되었는지 확인해야 합니다. Conda를 사용하여 환경 및 종속성을 관리하면 프로젝트를 격리하고 충돌을 방지하는 데 도움이 됩니다. 또한 Rust 컴파일러와 기타 필수 도구를 설치하면 컴파일이 필요한 패키지가 원활하게 처리됩니다.

이 가이드에 제공된 세부 단계와 스크립트를 따르면 일반적인 설치 장애물을 극복하고 macOS 시스템에서 RXNFP 모듈을 작동하고 실행할 수 있습니다. 원활한 설치 환경을 위해서는 적절한 환경 설정과 종속성 관리가 중요합니다.