Python siūlo keletą būdų, kaip vykdyti išorines programas ir iškviesti sistemos komandas tiesiai iš scenarijų. Pagrindiniai metodai apima modulio subprocess naudojimą komandoms paleisti ir jų išvesties fiksavimui bei funkcijos os.system naudojimą paprastesniam komandų vykdymui. Be to, modulis shlex gali padėti teisingai išanalizuoti apvalkalo komandas.