चुकून `.ecryptfs` आणि `.Private` फोल्डर मिटवल्यानंतर, एनक्रिप्टेड होम डिरेक्ट्री पुनर्प्राप्त करणे कठीण होऊ शकते. रॅप्ड-पासफ्रेज सारख्या महत्त्वाच्या फाइल्स पुन्हा तयार करण्यासाठी, गहाळ फाइल्स पुनर्प्राप्त करण्यासाठी आणि योग्य फोल्डरमध्ये त्यांची व्यवस्था करण्यासाठी PhotoRec सारखे प्रोग्राम कसे वापरायचे याचे वर्णन ही सूचना देते. डिक्रिप्टेड फोल्डर्स माउंट करणे आणि पुनर्प्राप्ती समस्यांचे निराकरण करणे हे महत्त्वाचे विषय आहेत.