Isu Apktool boleh menjadi sukar untuk diselesaikan semasa mengubah suai APK, terutamanya apabila ia melibatkan keserasian atribut. Menemui atribut yang tiada dalam AndroidManifest.xml semasa proses penciptaan APK, seperti android:allowCrossUidActivitySwitchFromBelow, biasanya menunjukkan ketidakserasian antara rangka kerja APK dan Apktool. Mengalih keluar sifat yang menyusahkan atau mengemas kini alat adalah jawapan praktikal. Untuk memastikan binaan yang lebih lancar dan kurang gangguan dalam prosedur penyesuaian APK, artikel ini menyahbina banyak teknik berasaskan skrip untuk mengautomasikan pembetulan ini. Isu berulang ini mudah diselesaikan oleh pembangun menggunakan kedua-dua skrip dan penyelesaian masalah langsung.