Apktool-problemen kunnen moeilijk op te lossen zijn tijdens het wijzigen van een APK, vooral als er sprake is van attribuutcompatibiliteit. Het vinden van ontbrekende kenmerken in AndroidManifest.xml tijdens het maken van de APK, zoals android:allowCrossUidActivitySwitchFromBelow, duidt meestal op incompatibiliteit tussen het APK-framework en Apktool. Het verwijderen van lastige eigenschappen of het updaten van tools zijn praktische antwoorden. Om soepelere builds en minder onderbrekingen in APK-aanpassingsprocedures te garanderen, deconstrueert dit artikel veel op scripts gebaseerde technieken voor het automatiseren van deze oplossingen. Deze terugkerende problemen kunnen eenvoudig door ontwikkelaars worden opgelost met behulp van zowel scripting als praktische probleemoplossing.