Det kan være vanskelig å sette opp et arbeidsmiljø for D3.js, spesielt for nybegynnere. Det er nødvendig å nøye koble JavaScript-filer, importere D3 og sørge for at datafilene dine er riktig tilkoblet. Å bruke en live server for å teste oppsettet ditt, som Node.js, kan også bidra til å forenkle utviklingen.