Deoarece browserul din aplicație al Instagram gestionează adresele URL într-o manieră limitată, linkurile profunde au adesea probleme de funcționare acolo. Acest lucru cauzează probleme pentru aplicațiile care folosesc scheme personalizate sau Legături universale în medii precum Flutter. Această constrângere poate fi abordată pentru a asigura o navigare fluidă în aplicație, configurând corect fișierul de asociere-aplicație-site-apple, testând comportamentul agentului utilizator și investigând instrumente precum urlgenius.