Nastavenie pracovného prostredia pre D3.js môže byť náročné, najmä pre nováčikov. Je potrebné starostlivo prepojiť JavaScript súbory, importovať D3 a zabezpečiť, aby boli vaše dátové súbory správne pripojené. Používanie živého servera na testovanie vášho nastavenia, napríklad Node.js, môže tiež pomôcť zjednodušiť vývoj.