Prechod z SVN na Git môže byť náročný, najmä pri práci s viacerými aplikáciami v rámci projektu IntelliJ. Každý modul teraz vyžaduje svoj vlastný vzdialený Git repozitár, čo zahŕňa nastavenie jednotlivých Git repozitárov a konfiguráciu IntelliJ na ich nezávislé spravovanie. Tento proces zahŕňa inicializáciu Gitu v každom module, pridanie vhodných vzdialených repozitárov a správne mapovanie adresárov v nastaveniach IntelliJ.