Python ponuja več načinov za izvajanje zunanjih programov in klicanje sistemskih ukazov neposredno iz skriptov. Ključne metode vključujejo uporabo modula subprocess za izvajanje ukazov in zajemanje njihovih rezultatov ter funkcijo os.system za enostavnejše izvajanje ukazov. Poleg tega lahko modul shlex pomaga pravilno razčleniti ukaze lupine.